原虫病是由原生动物寄生于动物而引起的一类寄生虫病。原虫是一种单细胞动物，常寄生于动物的体腔、体液、组织和细胞内，可以致病或不致病，对肉鸽危害比较严重的主要有球虫病、毛滴虫病、六鞭原虫病和疟原虫病等。
1鸽球虫病
1.1主要特点鸽球虫病是由艾美耳属球虫寄生于肠道引起的一种疾病，鸽很易感染，尤其对幼鸽危害严重。其传播的主要途径为消化道感染，死亡率较高，可达15%以上。幼鸽发病时的特征性症状是，排褐色糊状稀粪，间或排血便，贫血症状明显。此外，表现为精神不振，采食下降，羽毛松乱无光，翅膀下垂，日趋消瘦，很易死亡。病程在5～20天不等。剖检主要病理变化在小肠，表现为肠道卡他性或出血性炎症，肠壁充血、肿胀，有结节，肠腔充满凝固的粪血块。
1.2预防措施加强饲养管理，搞好清洁卫生，有计划的进行药物预防。喂给配合饲粮，满足肉鸽营养需要，增强机体抵抗力;平时加强环境卫生管理，定期消*，及时清除粪便及垫草;发现病鸽及时隔离治疗，并供给充足的营养，补充维生素;有计划地在饲料中添加抗球虫的药物进行预防，如氨丙啉0.%～0.%，磺胺喹嗯啉0.%～0.%，地克珠利1×10×E－6等，可较好地控制该病的发生。
1.3治疗措施一旦发生该病后，可及时采取以下措施进行治疗。
1.3.1磺胺二甲氧嘧啶0.05%～0.1%混入饲料或按0.%～0.05%的浓度饮水，连用2～4天。也可以选用三字球虫粉。
1.3.2百球清2×10×E－6饮水或拌料，连用3天。也可以配合一些中药如常山、柴胡、白茅根等进行治疗。在用药治疗期间，应添加维生素，尤其是维生素A、维生素B、维生素K等。
2毛滴虫病
2.1主要特点鸽毛滴虫病是鸽最常见的一种具有传染性的原虫病，任何品种、性别、龄期的鸽子均会发生，但1～8周龄幼鸽可出现严重症状与死亡。病原主要通过消化道、伤口及未闭合的脐孔进行传播。温热、潮湿天气更为多发。潜伏期3～15天，病程在4～25天不等。其主要症状及病变表现为病鸽常有吞咽动作，闭口困难，口腔内流出气味难闻的液体;食欲大减，饮欲增加，消化紊乱，体重很快下降，消瘦，拉*绿色稀粪;羽毛松乱，眼内有水状分泌物;死前病鸽眼结膜、口腔黏膜发绀，个别病鸽张口呼吸、咳嗽、气喘。剪开病鸽口腔、咽、食管、胃，见到黏膜上有*白色干酪样物，形成伪膜;有的隆起呈纽扣状，气味难闻，有的连成一片，堵塞了食道。肝脏表面有圆形或环状的绿豆大、有的玉米大小的白色或*色病灶。有的肠黏膜增厚，表面有糠麸样渗出物。有的呼吸道有黏液。在生产中有的以咽部症状为主，也有的以内脏症状为主，还有表现脐部症状的，要注意观察。该病诊断可以结合病理剖检变化，然后取用生理盐水沾湿的棉签，刮取病鸽口腔、嗉囊黏膜黏液置于载玻片上制成压片，倍光学显微镜暗视野观察，发现有许多梨形或椭圆形可活动的虫体，前端有4条鞭毛，边缘有一可波动的薄膜。由此确诊为鸽毛滴虫病。
2.2预防措施加强饲养管理，注意保持环境、运动场、栏舍、用具及饲料饮水的清洁卫生，特别是饲槽和垫料的卫生，做到每笼使用一个水槽，防止交叉感染;不同月龄的鸽应分群饲养;保持饲料的新鲜干净;清除设施的尖刺物，避免鸽体受伤;定期检查病原，发现带有虫体的感染鸽立即隔离治疗，并对全群采取药物预防，以防继续传播。也可以在乎时的保健砂中加入杀虫中草药如青蒿、蛇床子、花椒等。
2.3治疗措施用0.05%的二甲硝咪唑溶液饮水，连用2～3天，或按每kg饲料添加40g混饲，连用5天;鸽滴净按0.1%的浓度饮水2～3天;甲硝哒唑（灭滴灵），按0.05%饮水，连用2～5天。为确保疗效，用药后间隔5～7天可以再用药一次。
3六鞭原虫病
3.1主要特点本病是由火鸡六鞭原虫引起的，主要感染1～9周龄的火鸡、鸽，鸭、雏鸡、雉鸡、鹌鹑，孔雀及鹧鸪也可感染发生。本病对幼鸽的危害较大，如不及时治疗，死亡率可高达75%。主要经口感染，发病鸽以卡他性肠炎与泡沫性腹泻为主要症状。病初有神经质表现，敏感性增高，活动异常，畏寒，病鸽扎堆，呜叫，食欲减退，排水样或泡沫样粪便;后期精神沉郁，脱水消瘦，羽毛松乱无光，由水泻变为*色稀粪，最后衰竭昏迷，挣扎后死亡。剖检病变主要在肠道发生卡他性炎症，继发肠臌胀，肠内有水样或泡沫样液体，肝脏有浅*色的变色区。在显微镜下观察，肠腺窝内有大量的六鞭原虫。
3.2防治措施可以参照鸽毛滴虫病的防治措施，但注意用药时间，不管是预防还是治疗，一般连续用药3～6天。此外，本病还可以使用抗菌药物进行治疗。在饲料中添加0.%的丁醇锡或金霉素0.%等也具有较好的治疗作用。
4疟原虫病
4.1主要特点本病是疟原虫科鸽血变原虫引起的一种疾病，一年四季均可发生，吸血昆虫是主要传播媒介，如鸽虱、蚊、蝇、蜢等。在吸血昆虫孽生期，如夏、秋季节，最易发生本病的传播与流行。幼鸽发病表现急性经过，食欲不振，头缩毛松，贫血消瘦，呼吸加快或张口呼吸，部分病鸽体温偏低，数日内死亡，死亡率可达65%～75%。成鸽感染本病病原时，一般症状不明显，数日可自行恢复;有的转为慢性，但其抗病力、繁殖力下降，不愿孵化和哺育乳鸽，体质衰弱、贫血、消瘦等。剖检可见血液凝固不良，高度贫血，心肌可见出血，肌胃增大，肺水肿，肝、脾、肾肿大和硬化等病变。用内脏器官或血液涂片，罗曼诺夫斯基染料染色可见到红细胞中的滋养体或疟疾色素残余物。
4.2预防措施加强饲养管理，保持环境的清洁卫生。成功预防依赖于中断疟原虫的生活史，彻底消灭吸血昆虫，尤其是蚊子，避免传播。在保健砂中加入5%的青蒿全粉可有良好的预防作用。
4.3治疗措施磷酸伯氨喹啉片或磷酸氯喹片（每片含0.7mg），每片喂4只鸽子，每天一次，首次剂量加倍，连用7天，也可混于饮水中让鸽子自由饮用。